R语言ggplot2怎么画四方形的热图并展示相关系数

第一步是做相关性分析，获得相关系数

R语言里做相关性分析需要准备的数据格式如下：每行是一个样本，每列是一个变量，存储到excel中，然后另存为csv格式数据

 

需要示例数据的可以直接在文末留言

df<-read.csv("example_data/cor_plot_example.csv",
             header=T,
             row.names = 1)
df

直接用cor()函数获得相关系数矩阵

cordf<-cor(df)
cordf

plotdf<-reshape2::melt(cordf)
plotdf

最基本的热图

library(ggplot2)
ggplot(plotdf,aes(x=Var1,y=Var2))+
  geom_tile(aes(fill=value))

 

ggplot(plotdf,aes(x=Var1,y=Var2))+
  geom_tile(aes(fill=value))+
  scale_fill_gradient2(low="green",mid="white",high = "red")

 

ggplot(plotdf,aes(x=Var1,y=Var2))+
  geom_tile(aes(fill=value))+
  scale_fill_gradient2(low="green",mid="white",high = "red")+
  geom_text(aes(label=value))

 

plotdf$value<-round(plotdf$value,2)
ggplot(plotdf,aes(x=Var1,y=Var2))+
  geom_tile(aes(fill=value))+
  scale_fill_gradient2(low="green",mid="white",high = "red")+
  geom_text(aes(label=value))

 

包括去掉灰色背景，去掉坐标轴的标题和小短线

ggplot(plotdf,aes(x=Var1,y=Var2))+
  geom_tile(aes(fill=value))+
  scale_fill_gradient2(low="green",mid="white",high = "red")+
  geom_text(aes(label=value))+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.title = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank())