Spark系列（三）——弹性式数据集RDDs

弹性式数据集RDDs

一、RDD简介

RDD 全称为 Resilient Distributed Datasets，是 Spark 最基本的数据抽象，它是只读的、分区记录的集合，支持并行操作，可以由外部数据集或其他 RDD 转换而来，它具有以下特性：

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一个 RDD 由一个或者多个分区（Partitions）组成。对于 RDD 来说，每个分区会被一个计算任务所处理，用户可以在创建 RDD 时指定其分区个数，如果没有指定，则默认采用程序所分配到的 CPU 的核心数；
RDD 拥有一个用于计算分区的函数 compute；
RDD 会保存彼此间的依赖关系，RDD 的每次转换都会生成一个新的依赖关系，这种 RDD 之间的依赖关系就像流水线一样。在部分分区数据丢失后，可以通过这种依赖关系重新计算丢失的分区数据，而不是对 RDD 的所有分区进行重新计算；
Key-Value 型的 RDD 还拥有 Partitioner(分区器)，用于决定数据被存储在哪个分区中，目前 Spark 中支持 HashPartitioner(按照哈希分区) 和 RangeParationer(按照范围进行分区)；
一个优先位置列表 (可选)，用于存储每个分区的优先位置 (prefered location)。对于一个 HDFS 文件来说，这个列表保存的就是每个分区所在的块的位置，按照“移动数据不如移动计算“的理念，Spark 在进行任务调度的时候，会尽可能的将计算任务分配到其所要处理数据块的存储位置。

RDD[T] 抽象类的部分相关代码如下：

// 由子类实现以计算给定分区
def compute(split: Partition, context: TaskContext): Iterator[T]

// 获取所有分区
protected def getPartitions: Array[Partition]

// 获取所有依赖关系
protected def getDependencies: Seq[Dependency[_]] = deps

// 获取优先位置列表
protected def getPreferredLocations(split: Partition): Seq[String] = Nil

// 分区器 由子类重写以指定它们的分区方式
@transient val partitioner: Option[Partitioner] = None

二、创建RDD

RDD 有两种创建方式，分别介绍如下：

2.1 由现有集合创建

这里使用 spark-shell 进行测试，启动命令如下：

spark-shell --master local[4]

启动 spark-shell 后，程序会自动创建应用上下文，相当于执行了下面的 Scala 语句：

val conf = new SparkConf().setAppName("Spark shell").setMaster("local[4]")
val sc = new SparkContext(conf)

由现有集合创建 RDD，你可以在创建时指定其分区个数，如果没有指定，则采用程序所分配到的 CPU 的核心数：

val data = Array(1, 2, 3, 4, 5)
// 由现有集合创建 RDD,默认分区数为程序所分配到的 CPU 的核心数
val dataRDD = sc.parallelize(data) 
// 查看分区数
dataRDD.getNumPartitions
// 明确指定分区数
val dataRDD = sc.parallelize(data,2)

2.2 引用外部存储系统中的数据集

引用外部存储系统中的数据集，例如本地文件系统，HDFS，HBase 或支持 Hadoop InputFormat 的任何数据源。

val fileRDD = sc.textFile("/usr/file/emp.txt")
// 获取第一行文本
fileRDD.take(1)

使用外部存储系统时需要注意以下两点：

如果在集群环境下从本地文件系统读取数据，则要求该文件必须在集群中所有机器上都存在，且路径相同；
支持目录路径，支持压缩文件，支持使用通配符。

2.3 textFile & wholeTextFiles

两者都可以用来读取外部文件，但是返回格式是不同的：

textFile：其返回格式是 RDD[String] ，返回的是就是文件内容，RDD 中每一个元素对应一行数据；
wholeTextFiles：其返回格式是 RDD[(String, String)]，元组中第一个参数是文件路径，第二个参数是文件内容；
两者都提供第二个参数来控制最小分区数；
从 HDFS 上读取文件时，Spark 会为每个块创建一个分区。

def textFile(path: String,minPartitions: Int = defaultMinPartitions): RDD[String] = withScope {...}
def wholeTextFiles(path: String,minPartitions: Int = defaultMinPartitions): RDD[(String, String)]={..}

三、操作RDD

RDD 支持两种类型的操作：transformations（转换，从现有数据集创建新数据集）和 actions（在数据集上运行计算后将值返回到驱动程序）。RDD 中的所有转换操作都是惰性的，它们只是记住这些转换操作，但不会立即执行，只有遇到 action 操作后才会真正的进行计算，这类似于函数式编程中的惰性求值。

val list = List(1, 2, 3)
// map 是一个 transformations 操作，而 foreach 是一个 actions 操作
sc.parallelize(list).map(_ * 10).foreach(println)
// 输出： 10 20 30

四、缓存RDD

4.1 缓存级别

Spark 速度非常快的一个原因是 RDD 支持缓存。成功缓存后，如果之后的操作使用到了该数据集，则直接从缓存中获取。虽然缓存也有丢失的风险，但是由于 RDD 之间的依赖关系，如果某个分区的缓存数据丢失，只需要重新计算该分区即可。

Spark 支持多种缓存级别：

Storage Level<br/>（存储级别）	Meaning（含义）
`MEMORY_ONLY`	默认的缓存级别，将 RDD 以反序列化的 Java 对象的形式存储在 JVM 中。如果内存空间不够，则部分分区数据将不再缓存。
`MEMORY_AND_DISK`	将 RDD 以反序列化的 Java 对象的形式存储 JVM 中。如果内存空间不够，将未缓存的分区数据存储到磁盘，在需要使用这些分区时从磁盘读取。
`MEMORY_ONLY_SER`<br/>	将 RDD 以序列化的 Java 对象的形式进行存储（每个分区为一个 byte 数组）。这种方式比反序列化对象节省存储空间，但在读取时会增加 CPU 的计算负担。仅支持 Java 和 Scala 。
`MEMORY_AND_DISK_SER`<br/>	类似于 `MEMORY_ONLY_SER`，但是溢出的分区数据会存储到磁盘，而不是在用到它们时重新计算。仅支持 Java 和 Scala。
`DISK_ONLY`	只在磁盘上缓存 RDD
`MEMORY_ONLY_2`, <br/>`MEMORY_AND_DISK_2`, etc	与上面的对应级别功能相同，但是会为每个分区在集群中的两个节点上建立副本。
`OFF_HEAP`	与 `MEMORY_ONLY_SER` 类似，但将数据存储在堆外内存中。这需要启用堆外内存。

启动堆外内存需要配置两个参数：
spark.memory.offHeap.enabled：是否开启堆外内存，默认值为 false，需要设置为 true；
spark.memory.offHeap.size: 堆外内存空间的大小，默认值为 0，需要设置为正值。

4.2 使用缓存

缓存数据的方法有两个：persist 和 cache 。cache 内部调用的也是 persist，它是 persist 的特殊化形式，等价于 persist(StorageLevel.MEMORY_ONLY)。示例如下：

// 所有存储级别均定义在 StorageLevel 对象中
fileRDD.persist(StorageLevel.MEMORY_AND_DISK)
fileRDD.cache()

4.3 移除缓存

Spark 会自动监视每个节点上的缓存使用情况，并按照最近最少使用（LRU）的规则删除旧数据分区。当然，你也可以使用 RDD.unpersist() 方法进行手动删除。

五、理解shuffle

5.1 shuffle介绍

在 Spark 中，一个任务对应一个分区，通常不会跨分区操作数据。但如果遇到 reduceByKey 等操作，Spark 必须从所有分区读取数据，并查找所有键的所有值，然后汇总在一起以计算每个键的最终结果，这称为 Shuffle。

5.2 Shuffle的影响

Shuffle 是一项昂贵的操作，因为它通常会跨节点操作数据，这会涉及磁盘 I/O，网络 I/O，和数据序列化。某些 Shuffle 操作还会消耗大量的堆内存，因为它们使用堆内存来临时存储需要网络传输的数据。Shuffle 还会在磁盘上生成大量中间文件，从 Spark 1.3 开始，这些文件将被保留，直到相应的 RDD 不再使用并进行垃圾回收，这样做是为了避免在计算时重复创建 Shuffle 文件。如果应用程序长期保留对这些 RDD 的引用，则垃圾回收可能在很长一段时间后才会发生，这意味着长时间运行的 Spark 作业可能会占用大量磁盘空间，通常可以使用 spark.local.dir 参数来指定这些临时文件的存储目录。

5.3 导致Shuffle的操作

由于 Shuffle 操作对性能的影响比较大，所以需要特别注意使用，以下操作都会导致 Shuffle：

涉及到重新分区操作：如 repartition 和 coalesce；
所有涉及到 ByKey 的操作：如 groupByKey 和 reduceByKey，但 countByKey 除外；
联结操作：如 cogroup 和 join。

五、宽依赖和窄依赖

RDD 和它的父 RDD(s) 之间的依赖关系分为两种不同的类型：

窄依赖 (narrow dependency)：父 RDDs 的一个分区最多被子 RDDs 一个分区所依赖；
宽依赖 (wide dependency)：父 RDDs 的一个分区可以被子 RDDs 的多个子分区所依赖。

如下图，每一个方框表示一个 RDD，带有颜色的矩形表示分区：

区分这两种依赖是非常有用的：

首先，窄依赖允许在一个集群节点上以流水线的方式（pipeline）对父分区数据进行计算，例如先执行 map 操作，然后执行 filter 操作。而宽依赖则需要计算好所有父分区的数据，然后再在节点之间进行 Shuffle，这与 MapReduce 类似。
窄依赖能够更有效地进行数据恢复，因为只需重新对丢失分区的父分区进行计算，且不同节点之间可以并行计算；而对于宽依赖而言，如果数据丢失，则需要对所有父分区数据进行计算并再次 Shuffle。

六、DAG的生成

RDD(s) 及其之间的依赖关系组成了 DAG(有向无环图)，DAG 定义了这些 RDD(s) 之间的 Lineage(血统) 关系，通过血统关系，如果一个 RDD 的部分或者全部计算结果丢失了，也可以重新进行计算。那么 Spark 是如何根据 DAG 来生成计算任务呢？主要是根据依赖关系的不同将 DAG 划分为不同的计算阶段 (Stage)：

对于窄依赖，由于分区的依赖关系是确定的，其转换操作可以在同一个线程执行，所以可以划分到同一个执行阶段；
对于宽依赖，由于 Shuffle 的存在，只能在父 RDD(s) 被 Shuffle 处理完成后，才能开始接下来的计算，因此遇到宽依赖就需要重新划分阶段。

参考资料

张安站 . Spark 技术内幕：深入解析 Spark 内核架构设计与实现原理[M] . 机械工业出版社 . 2015-09-01
RDD Programming Guide
RDD：基于内存的集群计算容错抽象

更多大数据系列文章可以参见 GitHub 开源项目： 大数据入门指南

网站标题：Spark系列（三）——弹性式数据集RDDs
文章位置：https://www.cdcxhl.com/article34/ijecpe.html

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